МФК "Ухта" основан в 2006 году. Первые несколько лет коллектив провел в статусе любительской команды. Сезон 2011-2012 годов стал наиболее важным для болельщиков МФК «Ухта». Клуб заявился в Высшую лигу чемпионата России. Тренерский штаб во главе с Олегом Бондиным провел трансферную кампанию и подписал контракт с пятью футболистами: вратарями Александром Елфимовым и Максимом Пигулиным, а также тремя футболистами из глазовского «Прогресса»: Станиславом Арслановым, Никитой Кузнецовым и Евгением Аккузиным.

Дебютный сезон в Высшей лиге стал для ухтинцев непростым. Команда закончила первенство на предпоследнем месте, длительные безвыигрышные серии затмевали единичные случаи яркой и вдохновенной игры. Сезон 2012-2013 года команда провела более стабильно и смогла подняться на пятое место в чемпионате.  

Регулярный чемпионат 2014-2015 «Ухта» закончила в первой тройке. В конце сезона в "Ухту" приехал первый легионер в истории команды - бразилец Бруно. Появление в составе бразильского голкипера придало игрокам уверенности перед стадией плей-офф. Четвертьфинал, и полуфинал подопечные Александра Фролова начинали с поражения, но смогли найти в себе силы победить и выйти в финал, где соперником ухтинцев стала команда «Алмаз-Алроса» из города Мирый. В обеих финальных матчах «Ухта» победила с общим счетом 13:9, заработала золотые медали Первенства России среди клубов Высшей лиги и право выступить в сильнейшем дивизионе страны.